癌症治療領域極負盛名的歐洲腫瘤內科學會（ESMO）2022年年會中，Scott Kopetz教授，口頭報告了其研究團隊，根據名為BEACON臨床試驗結果， BRAF V600E基因突變的晚期大腸直腸癌因為藥物治療產生的獲得性抗藥基因組機制的研究探索成果，該項研究之結果有望可以協助這部分患者，更好地指導其後續的治療。
BRAF V600E基因突變的晚期大腸直腸癌在晚期腸癌中的發生率大約是8%，是預後不良的代表，與高年齡患者、女性、腫瘤原發於右半大腸、微衛星高度不穩定（MSI-H）等因素有相關性。且BRAF V600E基因突變的晚期大腸直腸癌疾病進展快、對化療反應不佳，所以一直是臨床治療上的難點和研究的熱點之一。
該研究背景，名為BEACON臨床試驗結果，使這部分患者的治療獲得了突破，它是一項隨機式的第3期臨床試驗。該研究乃是探討Encorafenib迫癌癒+EGFR標靶治療cetuximab±Binimetinib的方案與標準治療（對照）相比，發現Encorafenib+EGFR標靶治療cetuximab±Binimetinib的方案可以改善了既往已經接受過藥物治療的BRAFV600E突變之晚期大腸直腸癌患者的總生存期和客觀緩解率。研究結果顯示，與標準療法相比，三標靶(BRAF標靶治療 Encorafenib+EGFR標靶治療cetuximab+MEK標靶Binimetinib)或是二標靶(BRAF標靶治療 Encorafenib+EGFR標靶治療cetuximab)療法都具有更好的總體存活率和更高的腫瘤緩解率。三標靶與二標靶治療組的中位總體存活時間均為9.3個月，顯著優於標準治療組的5.9個月，三標靶與二標靶治療都可以比起傳統治療模式，更可以顯著降低死亡風險40%。
此次研究則是為了評估治療產生的獲得性抗藥基因，研究者分析了BEACON患者族群的循環腫瘤DNA（ctDNA）。
該研究的研究方法，係在臨床試驗入組治療前和治療結束時，採集晚期大腸直腸癌患者的血漿樣本並使用GuardantOMNI進行基因分析，以評估體細胞變異，包括非同義突變、擴增和重排。在個別患者中分析基因組變化來描述獲得性抗藥基因突變的特徵。
該研究的研究結果，臨床試驗入組治療前和治療惡化時的ctDNA中，可檢測到BRAF V600E突變的機率，分別為89.0%和88.7%。最常見的獲得性抗藥基因突變為KRAS突變、NRAS突變和MET擴增。
在59.8%的Encorafenib+EGFR標靶治療cetuximab的治療方案患者、56.3%的Encorafenib+EGFR標靶治療cetuximab+Binimetinib的方案患者和3.2%的對照治療患者中發現了至少一種抗藥基因突變，並且在Encorafenib+EGFR標靶治療cetuximab±Binimetinib的方案組中經常同時觀察到。Encorafenib+EGFR標靶治療cetuximab的治療方案患者中有16.1%獲得了MAP2K1突變，而Encorafenib+EGFR標靶治療cetuximab+Binimetinib的方案患者中僅有3.6%獲得MAP2K1突變。Encorafenib+EGFR標靶治療cetuximab的治療方案治療組有4.5%、1.8%和0.9%的患者獲得KRAS、BRAF和IGF1R擴增，Encorafenib+EGFR標靶治療cetuximab+Binimetinib的方案組有8.9%、5.4%和4.5%的患者獲得KRAS、BRAF和IGF1R擴增。
根據該項研究的結論發現，循環腫瘤DNA（ctDNA）分析顯示，MAPK訊號通路的再啟動是BRAF V600E基因突變的晚期大腸直腸癌患者，因為接受BRAF和EGFR±MEK標靶治療後產生獲得性抗藥性的共同機制。RAS-MEK訊號通路的獲得性突變在BRAF和EGFR雙標靶治療組中普遍地出現，而MAPK訊號通路的增強在BRAF和EGFR、MEK三標靶治療組中更是普遍地發生。
基於BEACON研究的接受BRAF和EGFR±MEK標靶治療後產生獲得性抗藥性分析發現，MAPK訊號通路的再啟動是BRAF V600E基因突變的晚期大腸直腸癌患者，因為接受BRAF和EGFR±MEK標靶治療後產生獲得性抗藥性的共同機制，此次公告的成果將為針對抗藥患者的研究和治療提供思路。
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