全球益生菌市場吸引了食品業的關注，促使人們生產含有益生菌的新產品，研究人員也開始研究益生菌的具體特性及其對人體健康的作用。據估計，到2023年，益生菌市場規模將達到693億美元。
益生菌可以營養保健品的形式食用，也可以作為發酵過程的一部分添加到食品中，或作為補充劑。益生菌通常作為膳食補充劑販售，其中的微生物可以乾燥並包裝成藥丸、膠囊、片劑或液體。幾十年來，目前益生菌食品市場主要集中在乳製品（優格和其他發酵產品），然而，乳糖不耐症和/或高膽固醇血症患者的增加要求改變這種現狀。越來越多的非乳製品食品基質（例如水果、蔬菜、穀物、肉製品和大豆）被認為是潛在的高活菌含量之益生菌載體，是一種無需乳蛋白和乳糖即可提供益處的有前景的替代品。蔬菜富含植物化學物質和植物營養素，而且由於不含乳糖，這些益生菌產品非常適合乳糖不耐症患者。捲心菜、胡蘿蔔、番茄、甜菜、洋蔥、生薑和花生等蔬菜已被用於配製益生菌產品。
乳酸桿菌（LAB）屬，例如嗜酸乳桿菌、植物乳桿菌、乾酪乳桿菌和長雙歧桿菌，已被用於植物性益生菌食品。穀物和豆類已被用於由高粱、小米粉、玉米、小米麥芽、小麥粉、小米、大豆、大米和燕麥製成的益生菌食品中。水果、蔬菜、穀物和豆類產品是富含營養成分的益生菌的良好載體。然而，一些限制因素可能會阻礙非乳製益生菌在工業層面的生產，例如感官特性、整體接受度，以及最重要的，益生菌在儲存期間的存活率等。
益生菌在發酵過程中發揮重要作用，因為它們通常可以提高益生菌培養物的活力。傳統上，益生菌會被添加到優格中，全球市場上有大量含有乳酸菌的產品，包括酸奶油、優酪乳、冷凍甜點和益生菌飲料。在此背景下，乳酸桿菌或雙歧桿菌是優格和發酵乳中最常用的益生菌培養物。
