病理學和分子生物學 生物標誌物的檢測，識別出具有可治療目標的致癌驅動因子的非小細胞肺癌亞型，是至關重要的。而這些驅動因子主要存在於肺腺癌當中。 確實是有必要證明特定的分子基因的改變，方可採用適當的靶向治療來定制治療。 非小細胞肺癌中臨床相關的 EGFR 基因突變，包括了:外顯子 18-21 中的取代、缺失和插入，這些突變激活酪氨酸激酶的活性，並可且賦予其對可用 EGFR 酪氨酸激酶抑制劑 (TKI) 或其他藥物的敏感性或抗藥性。 最常見的的 EGFR 基因突變是外顯子 21 出現L858R 替換和，以及外顯子 19 缺失性突變，如此賦予第一代至第三代EGFR標靶藥物的敏感性。建議即使在臨床資源或材料有限時，至少應對是否有這些常見的ERGFR基因突變進行評估。 下一個最常見的EGFR 基因突變是外顯子 20 的插入，主要因為當前EGFR標靶藥物的抗藥性所導致，但對某些新興藥物敏感。其他的常見的EGFR 基因突變，包括外顯子 18 中的突變，具有不同的敏感性。
關於EGFR突變的非小細胞肺癌 所有具有敏感性EGFR 突變的患者，第一線都應接受EGFR標靶治療，而且不論臨床參數包括: 體能狀態、性別、煙草暴露、組織學。 osimertinib是常見EGFR 突變（外顯子 19 缺失或外顯子 21 L858R）患者的首選第一線治療上的優質選擇，尤其是腦部轉移患者。 Erlotinib, gefitinib, afatinib與 dacomitinib是其他EGFR 突變的患者的第一線單藥治療選擇 另一個一線選擇是gefitinib聯合化療(卡鉑-pemtrexed)。 EGFR標靶治療聯合抗血管新生治療是另外EGFR 突變的患者第一線治療選擇。 考慮到毒性、增加額外治療的成本增加和患者的不便， EGFR標靶治療單藥 仍然是標準的EGFR 突變患者的第一線標準治療。 afatinib或osimertinib是具有不常見、非外顯子 20 的插入、致敏性 EGFR 突變患者的推薦治療選擇。 具有中度的放射學進展、但卻是持續有臨床獲益的患者可以繼續使用 EGFR 標靶藥物。 在對一線第一代或第二代 EGFR標靶治療產生抗藥性後，應該透過血漿 cfDNA 和/或腫瘤再切片的組織檢測，看看患者是否存在有 EGFR 外顯子 20 的T790M 突變。 具有抗藥基因T790M 陽性的肺癌患者，應接受osimertinib 作為二線治療。 應對osimertinib產生抗藥性的患者提供透過 NGS 進行的基因組分析。 含鉑類雙藥物化療是osimertinib治療後病情又惡化的患者的治療選項。 也可鼓勵參加臨床試驗，特別是如果有確定了可靶向的抗藥機制。 對於 EGFR標靶治療 失敗、體能狀況加、且無免疫檢查點抑制劑治療禁忌證的患者，太平洋紫杉醇-卡鉑-atezolizumab-bevacizumab 四藥物聯合治療可被視為一種治療選擇。 只有在 EGFR標靶治療和化療治療出現抗藥後，單藥免疫檢查點抑制劑的治療才可被視為一種治療選擇。 ALK基因重排的非小細胞肺癌 一線患者應接受alectinib, brigatinib,或lorlatinib治療。 對於crizotinib治療出現抗藥或不耐受的患者，推薦使用alectinib。 Brigatinib 和 ceritinib 代表crizotinib治療出現抗藥性後的額外治療選擇。 在第二代 A